2008年1月17日木曜日

統計環境RとそのGUIのJGRのインストール


 統計環境Rは、本来端末上でCUIで使用するソフトだが、いくつかのGUIがある。その中の一つ、JAVAベースの統計環境RのGUI、JGRの開発者のサイトにubuntuへのインストール方法が記述されていたので、それを参考に自分の環境にあわせて、多少改変、メモしておく。
 まず、Rをインストールする。筑波大学ミラーのリポジトリを追加する。システム→システム管理→Synaptics パッケージマネージャを開き、設定→リポジトリで、「サードパーティのソフトウェア」のタブを選んで、「+Add」で出てくる画面の「APT line:」の所に、下記をcopy&pasteする。
deb http://cran.md.tsukuba.ac.jp/bin/linux/ubuntu gutsy/
下記を端末から入力し、公開鍵を追加する。
gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821
gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add -
同じく端末から下記を入力し、Rのインストール
sudo apt-get update
sudo apt-get install r-base-dev r-recommended
次に、JDK6をインストールし、他のバージョンが入っている場合にはデフォルトに設定し、Rで利用できるようにする。
sudo apt-get install sun-java6-jdk
sudo update-java-alternatives -s java-1.6.0-sun
sudo R CMD javareconf
最後にJGRをインストールする。
sudo R
Rが起動したら、
install.packages('JGR')
library(JGR)
JGR()
JGRの使用法については、おいおいと。

2008年1月13日日曜日

"Scribd"でubuntu情報

 百式で紹介されていた文書共有サイト"Scribd"、YouTubeの文書版のサービスでワード形式やPDF形式でアップロードした文書がフラッシュ形式で公開されるというもの。今後、論文の発表や出版ということの概念を変えてくれそうな予感がします。ちなみに、"ubuntu"で検索すると、300弱の文書がヒットしたが、日本語のものは、まだみたいですね。

2008年1月10日木曜日

「遊び心」の伝統

 その昔、時々爆弾の出るMacを使っていた頃、固まっても許せたのは、その「遊び心」所以だったような気がします。Windowsにしてから、訳の分からないコメントを伴ったアラートが出てフリーズされると、いらついたものです。その辺は、患者さんとのコミュニケーションでも気を付けたいものです。
 その「遊び心」の伝統が、ubuntuにも引き継がれています。"AstralSin’s Blog"によると、端末から、
aptitude -v moo
とか
aptitude moo
とか入力してみると分かります。
 さらには、alt + F2 で「アプリケーションの実行」を立ち上げ、“gegls from outer space”と入力し、実行すると、ゲームができますよ。
 私の一番のお気に入りは、システム→システム管理→Synapticパッケージ・マネージャから"amor"を検索して、"a KDE creature for your desktop"と説明のあるソフトです。インストール後は、端末から、"amor"で起動します。とぼけたスマイリーが現れますが、マスコットを右クリックして"Configure..."を選択すると、他のマスコットを選べます。私の場合は、デスクトップで"NEKO"を飼っています。ちょっとした癒しですね。
 AMORというのは、"Amusing Misuse Of Resources"の略だそうですが、ラテン語では、「愛」という意味もあります。なかなか、含蓄のあるユーモアだと思いませんか?

2008年1月8日火曜日

2008年1月6日日曜日

私がubuntuを使い続ける10の理由

 私が、"ubuntu"を使い始めたのが、ちょうど約一年前の2月6日である。発端は、XPが起動しなくなったこと。自分のPCで動くかどうかも分からないVistaを買うのも癪で、Appleの新しいOS"Leopard"が出るまでの繋ぎのつもりで、インストールしたのがきっかけであった。しかし、新しいMacOS Xが出た今となっても、"ubuntu"を使い続けている。その屁理屈を10個列挙して見たい。
  1. 初回も、バージョンアップの時のインストールもWindowsよりはるかに簡単。
  2. シェアが少ないせいもあるのだろうが、ウイルスなどに対する安全性が高い。
  3. WindowsやMacと変わらず、GUIで一通りのことが出来る
  4. オフィスソフトや統計解析ソフトに限らず、無数のソフトが無料で手に入る。
  5. 困ったことがあっても、ネットを検索すれば、たいていのことは解決する。
  6. オープンソースの思想が、医療が目指すべき倫理の正義原則に則していること。
  7. オープンソースソフトを使用することで、一定の企業と利害の衝突が生じない。
  8. "ubuntu"の命名の由来が、"umuntu ngumuntu ngabantu"「人は、人々を通して、人である」という家庭医療の基本的な考えにも通ずるズールー語の箴言を含意していること。
  9. インターネットの普及によってパソコンが、「OS + アプリケーション」から、「ブラウザ + ネット上のサービス」になりつつあり、OSの違いによる不便が減ってきたこと。
  10. まとめると、「多くのリソース÷無料=∞のコストパフォーマンス」ってこと。

2007年12月28日金曜日

ubuntuで年賀状

 WindowsXPが壊れたときに、年賀状データもソフトも消失してしまい、今時期になって、バックアップの重要性が身にしみてます。そこで、Linux版TimeMachineとも言える"TimeVault"を導入。"Life is a gamble"というブログに詳しいインストールと設定の方法の解説がある。

 肝心の年賀状は、まず下記サイトで素材を集める。
 そしたら、Impressで10×14.8cmの白紙背景を開き、素材を読み込み、配置。Calcで住所録を作り、Baseに登録。宛名は、Writerで差し込み印刷。具体的方法は、OpenOffice.orgの公式ページに詳しい。 ここまでは順調だったが、なぜかプリンターHP Photosmart 8753側の問題か、連続印刷で紙送りがスムーズに行かず、一枚一枚印刷する事態に…なんとか、かんとか、完成させて、白石郵便局まで夜のドライブ、帰り は水源地通りを東北通りで左折、24時間のマックスバリューを見付け、いつもよりちょっと高級なつまみを手に入れ、幸せな気分になりましたとさ。